Apa perbedaan antara coomassie dan pewarnaan perak

Itu perbedaan utama Antara Coomassie dan Pewarnaan Perak adalah bahwa pewarnaan Coomassie adalah teknik pewarnaan protein yang menggunakan noda biru cemerlang coomassie, sementara pewarnaan sliver adalah teknik pewarnaan protein yang menggunakan noda perak.

Pemisahan dan identifikasi protein adalah langkah penting dalam analisis proteome. Mereka membutuhkan karakterisasi protein resolusi tinggi setelah elektroforesis gel. Ada banyak teknik pewarnaan yang mencakup noda yang berbeda seperti pewarna anionik (Coomassie Brilliant Blue), kation logam (imidazole-zinc), pewarnaan perak dan pewarna fluorescent, dll. Terkadang, probe radioaktif juga dapat digunakan. Pilihan teknik pewarnaan tergantung pada kesederhanaan, ketersediaan peralatan pencitraan di laboratorium, dll.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu pewarnaan coomassie
3. Apa itu Pewarnaan Perak
4. Kesamaan -coomassie dan pewarnaan perak
5. Coomassie vs pewarnaan perak dalam bentuk tabel
6. Ringkasan -Pewarnaan Coomassie vs Perak

Apa itu pewarnaan coomassie?

Pewarnaan Coomassie adalah teknik pewarnaan protein yang menggunakan noda biru coomassie brilian. Itu umumnya disebut Teknik Blue Coomassie. Coomassie Brilliant Blue adalah pewarna protein anionik paling populer. Noda ini biasanya menodai hampir semua protein dengan linearitas kuantitatif yang baik pada sensitivitas sedang. Coomassie Brilliant Blue Stain mengikat non-spesifik untuk hampir semua protein. Ada dua varian noda biru coomassie yang berbeda: R-250 dan G-250. R-250 menawarkan waktu pewarnaan yang lebih pendek, sedangkan G-250 tersedia dalam formulasi yang lebih sensitif dan ramah lingkungan.

Gambar 01: Pewarnaan Coomassie

Pewarna Coomassie sangat populer dalam studi spektrometri massa dan studi identifikasi protein. Selain itu, Noda Bio-Safe Coomassie adalah formulasi non-berbahaya dari Coomassie Blue G-250 yang saat ini tersedia di pasar. Keuntungan dari formulasi ini adalah hanya membutuhkan air untuk dibilas dan hancur. Noda Coomassie Bio-Safe menawarkan sensitivitas yang setara dengan Coomassie Blue G-250 konvensional tetapi lebih baik dari pewarnaan Coomassie R-250. Selain itu, ia memiliki protokol pewarnaan yang lebih sederhana dan lebih cepat daripada Coomassie Blue G-250 konvensional. Kelemahan pewarnaan coomassie biru adalah bahwa itu kurang sensitif dibandingkan dengan pewarnaan perak.  Pewarnaan Coomassie Blue sekitar 50 kali lipat kurang sensitif dari pewarnaan perak. Namun, karena kesederhanaannya dalam mengikat, lebih disukai dalam banyak penelitian.

Apa itu Pewarnaan Perak?

Pewarnaan perak adalah teknik pewarnaan protein yang menggunakan noda perak. Pewarnaan perak digunakan untuk menodai gel agarosa dan poliakrilamid. Pewarnaan perak protein dalam gel agarosa pertama kali dikembangkan pada tahun 1973 oleh Kerenyi dan Gallyas. Kemudian, itu diadaptasi untuk protein dalam gel poliakrilamida yang digunakan dalam SDS-PAGE. Saat ini, pewarnaan perak juga digunakan untuk pewarnaan DNA atau RNA. Untuk menodai gel, gel diinkubasi dengan larutan nitrat perak dalam metode ini. Pewarnaan perak menodai situs tempat protein hadir dari coklat ke hitam.

Gambar 02: Pewarnaan perak

Intensitas pewarnaan perak tergantung pada struktur utama protein. Selain itu, kebersihan kapal yang digunakan dan kemurnian reagen juga dapat mempengaruhi kualitas pewarnaan perak. Namun, kelemahan pewarnaan perak adalah tidak dapat mendeteksi semua protein, terutama glikoprotein dan protein dengan kelompok besar yang dimodifikasi yang melekat pada rantai samping mereka.

Apa kesamaan antara coomassie dan pewarnaan perak?

• Pewarnaan Coomassie dan perak adalah dua teknik yang digunakan dalam pewarnaan protein.
• Mereka dapat menodai protein dan DNA.
• Kedua teknik pewarnaan memiliki kelemahan.
• Teknik -teknik ini memiliki langkah yang serupa, seperti memperbaiki, pewarnaan, dan destaining.

Apa perbedaan antara coomassie dan pewarnaan perak?

Pewarnaan Coomassie adalah teknik pewarnaan protein yang menggunakan coomassie noda biru cemerlang, sedangkan pewarnaan sliver adalah teknik pewarnaan protein yang menggunakan noda perak. Dengan demikian, ini adalah perbedaan utama antara coomassie dan pewarnaan perak. Selanjutnya, pewarnaan Coomassie kurang sensitif daripada pewarnaan perak.

Infografis di bawah ini mencantumkan perbedaan antara coomassie dan pewarnaan perak dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.

Ringkasan -Pewarnaan Coomassie vs Perak

Untuk memvisualisasikan protein, pengikatan pewarna spesifik protein atau reaksi kimia penghasil warna dapat dilakukan. Ini disebut pewarnaan protein. Pewarnaan Coomassie dan perak adalah dua teknik yang digunakan dalam pewarnaan protein. Teknik Pewarnaan Coomassie Menggunakan Coomassie Brilliant Blue Noda sementara Pewarnaan Sliver Menggunakan Silver Stain. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara coomassie dan pewarnaan perak.

Referensi:

1. R, Brunelle JL, hijau. “Pewarnaan Blue Coomassie.”Metode dalam enzimologi, u.S. Perpustakaan Kedokteran Nasional.
2. Chevallet, Mireille, dkk. “Pewarnaan perak protein dalam gel poliakrilamid.Protokol alam, pub alam. Group, 2006.

Gambar milik:

1. "SDS-PAGE Coomasie diwarnai" oleh Piemmea-karya sendiri (CC BY-SA 3.0) Via Commons Wikimedia
2. "Page Agstain Microsat" oleh ParinoidMarvin - Karya Sendiri (CC BY -SA 3.0) Via Commons Wikimedia