Apa perbedaan antara profil polisom dan profil ribosom

Itu perbedaan utama Antara profil polisom dan profil ribosom adalah bahwa profil polisom menganalisis perilaku ribosom menggunakan ribosom dan mRNA (polisom) selama terjemahan, sementara profil ribosom menganalisis perilaku ribosom hanya menggunakan urutan mRNA selama terjemahan.

Terjemahan adalah fase kedua sintesis protein yang mengubah informasi dalam mRNA menjadi urutan asam amino. Translatomik adalah studi tentang ORF (bingkai bacaan terbuka) yang secara aktif diterjemahkan dalam sel suatu organisme. Teknik profil polisom dan ribosom adalah dua jenis teknik dalam bidang biologi molekuler untuk menilai dan menyimpulkan parameter yang berbeda dalam konteks menganalisis translatome.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu profil polisom
3. Apa itu profil ribosom
4. Kesamaan -profil polisom dan profil ribosom
5. Profil polisom vs profil ribosom dalam bentuk tabel
6. Ringkasan -Profil Polysome vs Profil Ribosome

Apa itu profil polisom?

Profil Polysome adalah teknik yang menyimpulkan status terjemahan mRNA spesifik dengan menganalisis perilaku ribosom dan mRNA (Polysome). Dengan kata lain, teknik ini memberikan data dan kesimpulan tentang asosiasi mRNA dengan ribosom. Polysome mengacu pada kelompok ribosom yang terikat pada mRNA yang hadir selama fase pemanjangan terjemahan.

Gambar 01: Profil Polysome

Profil polisom membutuhkan lisat sel, yang kemudian disentrifugasi. Sampel yang disentrifugasi kemudian dipisahkan berdasarkan kepadatannya untuk mengkarakterisasi subunit kecil dan besar dari ribosom dan mRNA yang sesuai yang terlibat dalam pembentukan polisom. Selain itu, proses ini juga melibatkan pengukuran kepadatan optik. Para ahli diharuskan melakukan profil polisom.

Teknik profil polisom adalah alat penting untuk banyak aplikasi. Para ilmuwan menggunakan teknik ini untuk mempelajari tingkat terjemahan dalam sel. Lebih khusus lagi, ini adalah alat untuk memberikan informasi yang akurat tentang studi protein individu dan mRNA spesifiknya. Dalam konteks mempelajari tingkat terjemahan mRNA tertentu, teknik profil polisom sangat penting. Di sini, urutan mRNA 3 'dan 5' dapat diselidiki dengan mengacu pada efeknya pada jumlah mRNA yang dihasilkan dan tingkat terjemahan.

Apa itu profil ribosom?

Profil ribosom adalah teknik yang menganalisis perilaku ribosom sehubungan dengan mRNA selama terjemahannya. Teknik ini ditemukan dan dikembangkan oleh Joan Steitz dan Marilyn Kozak. Kemudian teknologi ini dikembangkan lebih lanjut oleh dua ilmuwan, Nicholas dan Jonathan, dalam kombinasi dengan sekuensing generasi berikutnya, yang mengarah pada pengembangan teknik terkait yang berbeda seperti menerjemahkan metodologi pemurnian afinitas ribosom (TRAP).

Gambar 02: Sequencing Ribosome

Prosedur profil ribosom melibatkan mengisolasi mRNA, menghilangkan RNA yang tidak terikat pada ribosom, dan memisahkan mRNA yang terikat pada ribosom. Mengikuti prosedur ini, isolat mRNA ditranskripsi terbalik, dan sintesis cDNA terjadi. Akhirnya, data urutan dapat diselaraskan dengan profil translasi untuk menyimpulkan karakteristik perilaku ribosom sehubungan dengan mRNA.

Profil ribosom membantu banyak peneliti untuk mengidentifikasi dan menyimpulkan lokasi situs mulai terjemahan, pelengkap bingkai bacaan terbuka yang diterjemahkan (ORF) dalam sel atau jaringan, distribusi ribosom pada mRNA, dan laju menerjemahkan ribosom. Profil ribosom juga dikenal sebagai jejak kaki ribosom atau ribo seq.

Apa kesamaan antara profil polisom dan profil ribosom?

• Profil polisom dan ribosom adalah teknik biologis molekuler yang penting dalam penelitian.
• Mereka memberikan informasi tentang proses terjemahan.
• Kedua proses profil memberikan data melalui analisis translatome.
• Pakar profesional diperlukan untuk melakukan kedua teknik untuk hasil yang akurat.
• Alat bioinformatika memainkan peran penting dalam kedua teknik.

Apa perbedaan antara profil polisom dan profil ribosom?

Polysome Profiling menganalisis perilaku ribosom menggunakan ribosom dan mRNA (polisom) selama terjemahan, sementara profil ribosom menganalisis perilaku ribosom hanya menggunakan urutan mRNA selama terjemahan. Dengan demikian, ini adalah perbedaan utama antara profil polisom dan profil ribosom. Selain itu, profil polisom melibatkan teknik seperti sentrifugasi gradien kepadatan dan pengukuran kepadatan optik, sedangkan profil ribosom melibatkan ekstraksi mRNA dan teknik sekuensing. Juga, profil ribosom lebih akurat daripada profil polisom.

Infografis di bawah ini menyajikan perbedaan antara polisom dan profil ribosom dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.

Ringkasan -Profil Polysome vs Profil Ribosome

Terjemahan adalah fase kedua sintesis protein yang melibatkan mengubah informasi tentang urutan mRNA menjadi urutan asam amino. Proses ini membutuhkan templat mRNA, ribosom, asam amino, tRNA, dan faktor lainnya. Profil polisom dan ribosom adalah dua teknik molekuler. Polysome Profiling menganalisis perilaku ribosom menggunakan ribosom dan mRNA (polisom) selama terjemahan, sementara profil ribosom menganalisis perilaku ribosom hanya menggunakan urutan mRNA selama terjemahan. Profil polisom melibatkan teknik seperti sentrifugasi gradien kepadatan dan pengukuran kepadatan optik. Profil ribosom melibatkan teknik seperti ekstraksi mRNA, sintesis cDNA, dan sekuensing. Jadi, ini merangkum perbedaan antara profil polisom dan profil ribosom.

Referensi:

1. Chassé, Héloïse, dkk. “Analisis terjemahan menggunakan profil polisom.”Penelitian Asam Nukleat, 2016.
2. Jin, Hyun Yong, dan Changchun Xiao. “Metode profil polisom terintegrasi dan profil ribosom untuk menyelidiki translatome in vivo.”Metode dalam Biologi Molekuler, 2017, PP. 1-18., https: // doi.org/10.1007/978-1-4939-7514-3_1.

Gambar milik:

1. “Teknik Translatomik Penting” oleh Polyribosome - Karya Sendiri (CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia
2. "RibosomeprofileJpg" oleh Denpietras - karya sendiri (CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia