Apa perbedaan antara urutan Dalgarno dan Kozak Shine

Itu perbedaan utama Antara urutan Dalgarno dan Kozak adalah sekuens Shine Dalgarno adalah situs pengikatan ribosom dalam RNA bakteri dan messenger archaeal, sedangkan urutan kozak adalah situs inisiasi terjemahan protein di sebagian besar rnas messenger eukariotik.

Urutan Shine Dalgarno dan Kozak adalah dua urutan konsensus yang sangat penting untuk inisiasi terjemahan. Dalam biologi molekuler, terjemahan adalah proses di mana ribosom dalam sitoplasma mensintesis protein setelah proses transkripsi. Dalam terjemahan, mRNA (messenger RNA) diterjemahkan dalam ribosom untuk menghasilkan rantai asam amino spesifik di luar nukleus. Biasanya, ribosom menginduksi proses decoding dengan memfasilitasi pengikatan sekuens antikodon tRNA komplementer dengan kodon mRNA. Terjemahan hasil dalam tiga tahap: inisiasi, perpanjangan dan penghentian.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu urutan dalgarno bersinar
3. Apa urutan kozak
4. Kesamaan - Shine Dalgarno dan Kozak Sequence
5. Shine Dalgarno vs Kozak Sequence dalam bentuk tabel
6. Ringkasan -Shine Dalgarno vs Kozak Sequence

Apa itu urutan dalgarno bersinar?

Urutan Shine Dalgarno adalah situs pengikatan ribosom di RNA bakteri dan archaeal messenger. Umumnya terletak di sekitar 8 pangkalan di hulu kodon start aug. Urutan RNA ini membantu dalam merekrut ribosom ke RNA messenger dengan menyelaraskan ribosom dengan kodon start mRNA. Dengan demikian, ia memulai sintesis protein. Sekali setelah perekrutan, tRNA dapat menambahkan asam amino secara berurutan seperti yang ditentukan oleh kodon mRNA. Urutan khusus ini sering terjadi pada bakteri tetapi lebih jarang di archaea. Selain itu, ini juga ada dalam transkrip kloroplas dan mitokondria. Urutan Shine Dalgarno pertama kali diusulkan oleh para ilmuwan Australia John Shine dan Lynn Dalgarno. Enam urutan konsensus dasar adalah aggagg. Misalnya, di Escherichia coli Urutannya adalah aggaggu.

Gambar 01: Urutan Shine Dalgarno

Pemilihan Situs Inisiasi (AUG) tergantung pada interaksi antara subunit 30 -an dari ribosom dan template mRNA. Daerah kaya pirimidin pada komponen 16SrRNA dari subunit 30-an berikatan dengan daerah kaya purin yang dikenal sebagai urutan kodon inisiasi AUG yang kilau di mRNA dalam mRNA. Selain itu, selama pembentukan kompleks inisiasi, urutan nukleotida komplementer ini berpasangan untuk membentuk struktur RNA untai ganda. Ini memfasilitasi pengikatan mRNA ke ribosom sedemikian rupa sehingga kodon inisiasi ditempatkan di lokasi P ribosome.

Apa urutan kozak?

Kozak Sequence adalah situs inisiasi terjemahan protein di sebagian besar mRNA eukariotik. Urutan ini juga disebut urutan konsensus Kozak. Urutan kozak adalah urutan optimal untuk memulai terjemahan dalam eukariota. Urutan ini merupakan aspek integral dari regulasi protein. Ini juga sangat penting untuk kesehatan seluler secara keseluruhan. Ini membantu memperbaiki terjemahan protein dari pesan genetik dengan memediasi perakitan ribosom dan inisiasi terjemahan.

Gambar 02: Urutan Kozak

Urutan ini dinamai setelah ilmuwan yang menemukannya, Marilyn Kozak. Dia menemukannya melalui analisis terperinci dari urutan genom DNA. Urutan Kozak adalah 5 '(GCC) GCCRCCAUGG-3'. Huruf-huruf kasus atas menunjukkan basis yang dilestarikan, sedangkan huruf kasus bawah menunjukkan basis variabel umum. R menunjukkan purin (adenin atau guanin) yang selalu diposisikan di lokasi ini.

Apa kesamaan antara urutan bersinar Dalgarno dan Kozak?

• Urutan Shine Dalgarno dan Kozak adalah dua urutan konsensus yang sangat penting dalam inisiasi terjemahan.
• Keduanya adalah urutan RNA.
• Subunit yang lebih kecil dari ribosom berikatan dengan kedua urutan.
• Kedua urutan memediasi perakitan ribosom yang tepat dan inisiasi terjemahan.
• Mereka adalah aspek integral dari regulasi protein dan kesehatan seluler secara keseluruhan.

Apa perbedaan antara urutan Dalgarno dan Kozak Shine?

Urutan Shine Dalgarno adalah situs pengikatan ribosom yang ditemukan di RNA bakteri dan messenger archaeal, sedangkan sekuens kozak adalah situs inisiasi terjemahan protein yang ditemukan di kebanyakan RNA messenger eukariotik RNA. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara urutan Shine Dalgarno dan Kozak. Selanjutnya, urutan Dalgarno bersinar adalah 5'Aggaggu3 'sementara, urutan kozak adalah 5' (GCC) GCCRCCAUGG-3 '.

Infografis berikut ini mencantumkan perbedaan antara urutan kozak kozak dan kozak dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.

Ringkasan -Shine Dalgarno vs Kozak Sequence

Urutan Shine Dalgarno dan Kozak adalah dua urutan konsensus RNA yang sangat penting untuk perakitan ribosom dan inisiasi terjemahan. Urutan Shine Dalgarno adalah situs pengikatan ribosom di RNA bakteri dan archaeal messenger, sedangkan urutan kozak adalah situs inisiasi terjemahan protein di kebanyakan RNA messenger eukariotik. Dengan demikian, ini merangkum perbedaan antara urutan bersinar Dalgarno dan Kozak.

Referensi:

1. “Urutan Shine-Dalgarno."Tinjauan umum | Topik ScienceDirect.
2. “Urutan Konsensus Kozak."Tinjauan umum | Topik ScienceDirect.

Gambar milik:

1. “Shine-Dalgarno Sequence-Es” oleh Shakiestone. Versión en Español de Alejandro Porto - File: Shine -Dalgarno Sequence.PNG (CC BY-SA 3.0) Via Commons Wikimedia
2. “Peraturan Terjemahan oleh 5 'Transkrip Pemimpin CIS-Elements” oleh APFEL412-Karya Sendiri (CC BY-SA 4.0) Via Commons Wikimedia