Apa perbedaan antara isoskizomer dan neoskizomer

Apa perbedaan antara isoskizomer dan neoskizomer

Itu Perbedaan utama antara isoskizomer dan neoskizomer adalah bahwa isoskizomer adalah enzim restriksi yang memiliki urutan pengakuan yang sama dan memecah DNA pada posisi yang sama, sedangkan neoskizomer adalah enzim restriksi yang memiliki urutan pengakuan yang sama tetapi membelah DNA pada posisi yang berbeda.

Enzim restriksi atau restriksi endonuklease adalah enzim yang membelah DNA menjadi fragmen di atau dekat situs pengakuan spesifik. Mereka memotong DNA di situs pembatasan. Enzim pembatasan biasanya diklasifikasikan ke dalam lima kelompok berdasarkan struktur, apakah mereka memotong substrat DNA mereka di situs pengakuan mereka, dan apakah situs pengakuan dan pembelahan terpisah satu sama lain. Lebih dari 3600 pembatasan endonuklease telah diidentifikasi. Sekitar 800 enzim pembatasan tersedia secara komersial. Isoskizomer dan neoskizomer adalah dua jenis enzim pembatasan berdasarkan situs pengakuan dan spesifisitas pembelahan.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu isoskizomer 
3. Apa itu neoskizomer
4. Kesamaan -isoskizomer dan neoskizomer
5. Isoschizomer vs neoschizomer dalam bentuk tabel
6. Ringkasan -Isoschizomer vs Neoschizomer

Apa itu isoskizomer?

Isoskizomer adalah enzim restriksi yang memiliki urutan pengakuan yang sama dan membelah DNA pada posisi yang sama. Enzim pembatasan ini memiliki spesifisitas yang sama. Enzim restriksi pertama yang ditemukan yang mengenali urutan yang diberikan dikenal sebagai prototipe, sementara semua enzim pembatasan yang diidentifikasi kemudian mengakui bahwa urutan yang sama disebut isoskizomer. Namun, isoskizomer mungkin berbeda dalam preferensi lokasi, kondisi reaksi, sensitivitas metilasi, dan aktivitas bintang. Isoskizomer diisolasi dari berbagai jenis bakteri. Oleh karena itu, mereka mungkin memerlukan kondisi reaksi yang berbeda. Dalam beberapa kasus, hanya satu dari sepasang isoskizomer yang dapat mengenali bentuk -bentuk situs pembatasan yang dimetilasi dan tidak dimetilasi. Di sisi lain, enzim pembatasan lainnya hanya dapat mengenali bentuk yang tidak dimetilasi dari situs pembatasan. Fitur khusus isoskizomer ini membantu identifikasi keadaan metilasi situs pembatasan sambil mengisolasi dari keadaan bakteri.

Misalnya, Agei dan Bsht1 mengenali dan membelah 5'-A ↓ CCGGT dalam pola yang sama. HPAII dan MSPI adalah pasangan isoskizomer lainnya. Mereka berdua mengenali urutan 5'-C ↓ CGG-3 'saat tidak dimetilasi. Tetapi ketika C kedua dari urutan dimetilasi, hanya MSPI yang dapat mengenali urutan ini sementara HPAII tidak dapat mengenalinya.

Apa itu neoskizomer?

Neoskizomer adalah enzim restriksi yang memiliki urutan pengakuan yang sama tetapi membelah DNA pada posisi yang berbeda. Dalam beberapa aplikasi biologis molekuler khusus, ini adalah fitur yang sangat membantu. Neoskizomer adalah subset dari isoskizomer. Contoh-contoh terkenal untuk neoskizomer adalah SMAI (5'-CCC ↓ GGG-3 ') dan XMAI (5'-C ↓ CCGGG-3'); Keduanya mengenali urutan 5'-cccggg-3 'tetapi membelahnya pada posisi yang berbeda. Dengan demikian, kedua enzim pembatasan ini menghasilkan berbagai jenis ujung. Dalam hal ini, SMAI menghasilkan ujung tumpul, dan Xmai menghasilkan ujung 5 'yang menonjol.

Gambar 01: Neoskizomer

Contoh lain adalah pasangan enzim maeii dan pembatasan ekor. Prototipe MAEII (A ↓ CGT) menghasilkan fragmen DNA dengan 2-base 5'extension, dan ekor neoskizomer (ACGT ↓) menghasilkan fragmen DNA dengan ekstensi 4-base3 '.

Apa kesamaan antara isoskizomer dan neoskizomer?

  • Isoskizomer dan neoskizomer adalah dua jenis enzim pembatasan.
  • Mereka sebagian besar ditemukan di prokariota.
  • Mereka adalah bagian dari sistem pembatasan-modifikasi (RM) yang ditemukan pada bakteri dan archaea.
  • Keduanya adalah molekul protein.
  • Keduanya membelah DNA menjadi fragmen.

Apa perbedaan antara isoskizomer dan neoskizomer?

Isoskizomer adalah enzim restriksi yang memiliki urutan pengakuan yang sama dan memecah DNA pada posisi yang sama, sedangkan neoskizomer adalah enzim restriksi yang memiliki urutan pengenalan yang sama tetapi membelah DNA pada posisi yang berbeda. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara isoskizomer dan neoskizomer. Selain itu, isoskizomer memiliki kekhususan yang sama sementara neoskizomer memiliki kekhususan yang berbeda.

Infografis berikut mencantumkan perbedaan antara isoskizomer dan neoskizomer dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.

Ringkasan -Isoschizomer vs Neoschizomer

Enzim pembatasan adalah enzim pemotongan DNA. Mereka juga disebut gunting molekuler. Ada berbagai jenis enzim pembatasan. Berdasarkan situs pengakuan dan spesifisitas pembelahan, enzim restriksi adalah dua jenis sebagai isoskizomer dan neoskizomer. Isoschizomer memiliki urutan pengakuan yang sama dan membelah DNA pada posisi yang sama sementara neoskizomer memiliki urutan pengakuan yang sama tetapi membelah DNA pada posisi yang berbeda.  Dengan demikian, ini adalah perbedaan utama antara isoskizomer dan neoskizomer.

Referensi:

1. “Isoschizomer."Tinjauan umum | Topik ScienceDirect.
2. “Enzim Pembatasan: Jenis & Contoh.”Studiousguy, 4 September. 2018.

Gambar milik:

1. "Taiimae" oleh Inks002 di Wikipedia Inggris (CC BY-SA 3.0) Via Commons Wikimedia