Perbedaan antara grup I dan intron Grup II

Itu perbedaan utama Antara intron Grup I dan Grup II adalah itu Pada intron Grup I, reaksi splicing diprakarsai oleh kofaktor guanosin, sedangkan pada intron Grup II, reaksi splicing diprakarsai oleh adenosin internal.

Pra-mRNA adalah transkrip utama yang memiliki intron dan ekson. Pra-mRNA harus dikonversi menjadi mRNA sebelum terjemahan. Penyambungan RNA atau splicing pra-mRNA adalah salah satu modifikasi pasca transkripsional. Dalam splicing RNA, intron dikeluarkan dari molekul pra-mRNA, dan ekson bergabung bersama. Intron Grup I dan Grup II adalah intron pelayaran mandiri. Mereka menyambung dari molekul pra-mRNA tanpa bantuan enzim lainnya. Oleh karena itu, mereka adalah enzim RNA atau ribozim yang mengkatalisasi splicing mereka sendiri dari pra-mRNA. Selain itu, mereka memiliki kemampuan untuk berfungsi sebagai elemen seluler. Selama splicing, serangkaian reaksi trans-esterifikasi terjadi untuk mengurangi intron dan mengikat ekson. Ribozim ini hadir di ketiga domain, termasuk bakteri, archaea dan eukariota.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Grup I Intron
3. Apa itu Intron Group II
4. Kesamaan antara intron Grup I dan Grup II
5. Perbandingan Berdampingan - Intron Grup I Vs Group II dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu Grup I Intron?

Intron Grup I adalah jenis ribozim pelarut mandiri yang ditemukan pada bakteri, bakteriofag dan eukariota (genom organel dan nuklir). Mereka ditemukan dalam gen penting. Mereka dapat mengkatalisasi splicing mereka sendiri dari molekul pra-mRNA. Grup I Intron mungkin memiliki beberapa ratus hingga tiga ribu nukleotida. Selain itu, mereka menunjukkan sedikit kesamaan urutan di seluruh organisme.

Gambar 01: Grup I Intron

Struktur sekunder sangat dilestarikan di empat daerah pendek. Ada dua langkah reaksi transesterifikasi dari splicing. Grup I Intron memulai mekanisme splicing dengan serangan nukleofilik dari 3 'hidroksil kofaktor guanosin di lokasi sambungan 5P.

Apa itu Intron Group II?

Intron Grup II adalah jenis intron pelayaran mandiri yang ditemukan dalam organisme yang termasuk dalam ketiga domain. Mereka adalah ribozim yang mengkatalisasi reaksi splicing mereka sendiri dari pra-mRNA. Mereka ditemukan dalam gen rRNA, tRNA dan pengkode protein. Tetapi mereka tidak ditemukan dalam genom nuklir, tidak seperti intron kelompok I.

Gambar 02: Intron Grup II

Intron Group II Katalise splicing melalui dua langkah transesterifikasi yang mirip dengan intron Grup I. Enzim ini memulai reaksi splicing dengan serangan nukleofilik 2 'OH dari situs cabang adenosin pada persimpangan 5' splice. Selama reaksi splicing, intron Grup II membentuk struktur seperti Lariat. Selain itu, splicing intron terjadi tanpa adanya GTP.

Apa kesamaan antara intron Grup I dan Grup II?

• Intron Grup I dan Grup II adalah dua jenis enzim RNA, ribozim yang mengkatalisasi splicing mereka sendiri dengan mekanisme yang berbeda.
• Mereka adalah ribozim besar.
• Keduanya ditemukan di ketiga domain.
• Mereka adalah elemen seluler.
• Selain itu, mereka ditemukan dalam gen rRNA, tRNA dan pengkode protein.
• Kedua enzim menggunakan alat dalam bioteknologi dan pengobatan molekuler untuk knock-out/knock-down, pengiriman gen atau sistem terapi gen yang ditargetkan.

Apa perbedaan antara intron Grup I dan Grup II?

Intron kelompok I adalah ribozim yang ditemukan pada bakteri, bakteriofag dan genom organel dan nuklir eukariotik dan genom nuklir. Intron kelompok II adalah ribozim yang ditemukan pada bakteri, archaea, dan organel eukariotik. Selain itu, intron Grup I memulai reaksi splicing dengan serangan nukleofilik dari 3 'hidroksil dari kofaktor guanosin di situs sambungan 5P sementara intron kelompok II memulai reaksi splicing dengan serangan nukleofilik dari 2' OH dari situs cabang adenosin pada the the Persimpangan 5 '. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara intron Grup I dan Grup II.

Selanjutnya, intron Grup II membentuk struktur seperti Lariat selama splicing sementara intron Grup I tidak terbentuk. Jadi, ini adalah perbedaan signifikan lainnya antara intron Grup I dan Grup II. Selain itu, intron Grup I ditemukan dalam genom nuklir eukariotik sementara intron kelompok II tidak ditemukan dalam genom nuklir eukariotik.

Di bawah ini mencantumkan perbedaan antara intron Grup I dan Grup II dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.

Ringkasan -Intron Grup I vs Group II

Intron Grup I dan II adalah ribozim besar yang mengkatalisasi reaksi transesterifikasi untuk menyambungkan intron dari transkrip utama. Mereka ditemukan di ketiga domain. Keduanya adalah elemen genetik seluler. Selain itu, mereka digunakan sebagai alat dalam bioteknologi dan pengobatan molekuler. Namun, intron Grup I memulai reaksi splicing dengan serangan nukleofilik dari kofaktor guanosin 3 'OH di lokasi sambungan 5P. Tapi, intron Grup II memulai reaksi splicing dengan serangan nukleofilik dari 2 'OH dari situs cabang adenosin pada persimpangan 5' splice. Selain itu, intron Grup II membentuk struktur seperti Lariat selama splicing sementara intron Grup I tidak membentuk struktur seperti Lariat. Jadi, ini adalah ringkasan perbedaan antara intron Grup I dan Grup II.

Referensi:

1. Bonen, J. Vogel, dkk. “Evolusi intron kelompok II.DNA seluler, Biomed Central, 1 Januari. 1970, tersedia di sini.
2. Tourasse, Nicolas J, dan Anne-Brit Kolstø. “Survei intron Grup I dan Grup II dalam 29 genom berurutan dari kelompok Bacillus cereus: wawasan tentang penyebaran dan evolusi mereka.”Penelitian Asam Nukleat, Oxford University Press, AUG. 2008, tersedia di sini.

Gambar milik:

1. "RF00028" dengan gambar ini diambil dari database RFAM (domain publik) melalui Commons Wikimedia
2. "Introngroupii" oleh pengguna: Sangak - pekerjaan sendiri (domain publik) melalui Commons Wikimedia