Perbedaan antara transposon dan retrotransposon

Transposon vs Retrotransposon

Transposon dan retrotransposon adalah komponen genetik DNA, dan ada perbedaan besar di antara mereka. Persentase keberadaan bahan genetik ini bervariasi di seluruh spesies, dan fungsinya menentukan nasib organisme dengan mutasi dan perubahan penting lainnya secara fenotip. Transposon dan retrotransposon adalah gen atau koleksi gen tertentu yang terletak di untaian DNA, dan perubahan lokasi mereka telah menjadi penyebab utama konsekuensi ini. Namun, artikel ini bermaksud untuk membahas fungsi gen -gen ini secara singkat dan menyajikan perbandingan antara transposon dan retrotransposon.

Apa itu transposon?

Transposon adalah fragmen yang menarik atau segmen DNA dengan kemampuan untuk mengubah lokasi untai DNA dalam bentuk mekanisme pemotongan dan pasta. Karena sifat transposon seluler ini, ini dikenal sebagai gen jumping. Transposon dari dua jenis utama yang dikenal sebagai transposon Kelas I dan transposon Kelas II. Biasanya, tipe Kelas II disebut sebagai transposon dan jenis Kelas I disebut sebagai retrotransposon. Proses pemotongan dan pemasangan segmen DNA seluler diatur oleh enzim transposase. Enzim berikatan dengan kedua ujung transposon dan memotong ikatan fosfodiester dari untai DNA, mengisolasi transposon, memindahkannya ke situs target, dan mengikat di lokasi baru. Namun, proses ini menarik untuk dipahami, karena beberapa transposon hanya dapat pindah ke lokasi tertentu hanya karena ketidakcocokan urutan dasar dengan situs target. Gen dengan satu ujung untai tunggal memiliki urutan dasar yang sama dengan ujung lain dari untai tunggal lainnya adalah transposon dengan tepi lengket, karena mereka dapat mengikat ke situs untai DNA target dengan urutan dasar yang sama seperti pada ujung lengket. Namun, mobilitas gen ini dapat menyebabkan perubahan genotipe serta dalam fenotipe organisme. Para ilmuwan yang ditemukan tentang transposon dan makanan dan organisme yang dimodifikasi secara genetik sesuai dengan kustomisasi yang disukai kemudian tersedia. Tanaman pertanian yang sangat produktif, antibiotik dengan sifat obat, hewan ternak adalah beberapa produk yang dikembangkan secara menguntungkan setelah penemuan transposon oleh Barbara McClintock pada tahun 1940 -an.

Apa itu retrotransposon?

Retrotransposon adalah transposon Kelas I, dan ini bergerak melalui genom melalui mekanisme salinan dan tempel. Mekanisme mobilitas retrotransposon melibatkan beberapa langkah utama seperti menyalin segmen gen dari untai DNA ke RNA, transfer salinan RNA ke situs target, transkripsi urutan RNA kembali ke DNA menggunakan reverse transcriptase, dan penyisipan gen ke lokasi baru untai genom DNA. Dua ujung retrotransposon ini biasanya memiliki pengulangan terminal panjang dengan sekitar 1000 pasangan basa, dan itu digunakan sebagai fitur identifikasi gen ini. Gen -gen ini mudah diamplifikasi di dalam genom, dan persentase retrotransposon dalam genom manusia adalah sekitar 50%. Ini bisa sangat berbahaya karena virus penyebab AIDS, HIV, dan virus leukemia sel T memiliki retrotransposon dalam genom RNA mereka. Faktanya, virus ini dapat mengikat retrotransposon ke situs mana pun dari untaian DNA manusia dengan penggunaan reverse transcriptase dan integrase. Enzim integrase berfungsi dengan cara yang sama seperti transposase di transposon kelas II.