Apa perbedaan antara CGH dan array CGH

Itu perbedaan utama Antara CGH dan Array CGH adalah bahwa CGH adalah metode sitogenetik molekuler tradisional untuk menganalisis variasi jumlah salinan dalam DNA sampel uji yang memiliki resolusi yang lebih rendah, sedangkan array CGH adalah metode sitogenetik molekul sepenuhnya otomatis untuk menganalisis variasi jumlah salinan dalam DNA dari sampel uji yang memiliki a resolusi lebih tinggi.

CGH dan array CGH adalah dua teknik untuk mendeteksi variasi nomor salinan pada individu. Variasi nomor salinan mengacu pada bagian genom yang diulangi. Nomor salin bervariasi antara individu. Variasi nomor salin umumnya dikategorikan ke dalam dua kelompok: pengulangan pendek dan pengulangan panjang. Salah satu contoh paling terkenal untuk variasi nomor salinan pendek adalah pengulangan cag trinucleotide dalam gen huntingtin. Ini menyebabkan gangguan neurologis yang disebut Huntingtin. Contoh terbaik untuk variasi nomor salinan pengulangan panjang adalah gen alfa amilase, yang menyebabkan resistensi insulin. Variasi nomor salinan dapat dideteksi dengan teknik seperti ikan, cgh, dan array cgh.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu CGH 
3. Apa itu array cgh
4. Kesamaan - CGH dan array CGH
5. Cgh vs array cgh dalam bentuk tabel
6. Ringkasan - CGH vs Array CGH

Apa itu CGH?

CGH adalah metode sitogenetik molekuler tradisional untuk menganalisis variasi jumlah salinan dalam DNA sampel uji dibandingkan dengan sampel referensi. Ini memiliki resolusi yang lebih rendah dibandingkan dengan teknik otomatis. Tujuan dari teknik ini adalah dengan cepat dan efisien membandingkan dua sampel DNA genom yang muncul dari berbagai sumber.

Gambar 01: CGH

Prosedur ini melibatkan isolasi DNA dari dua sumber: tes dan referensi. Kemudian langkah selanjutnya adalah pelabelan independen dari uji dan sampel DNA referensi dengan fluorofor dengan warna yang berbeda. Kemudian, kedua sampel DNA didenaturasi untuk mendapatkan sampel DNA untai tunggal. Akhirnya, hibridisasi dua sampel DNA yang dihasilkan dalam rasio 1: 1 terhadap penyebaran metafase normal kromosom dilakukan. Perbedaan kromosom dapat diidentifikasi antara kedua sumber menggunakan mikroskop fluoresensi dan perangkat lunak komputer. Selain itu, teknik CGH hanya mampu mendeteksi kelainan kromosom yang tidak seimbang.

Apa itu array cgh?

Array CGH adalah metode sitogenetik molekuler sepenuhnya otomatis untuk menganalisis variasi jumlah salinan dalam DNA sampel uji dibandingkan dengan sampel referensi. Ini memiliki resolusi yang lebih tinggi, dan dikembangkan untuk meminimalkan keterbatasan CGH tradisional. Array CGH menggabungkan prinsip -prinsip CGH dengan penggunaan microarrays. Alih -alih menggunakan spread kromosom metafase, metode ini menggunakan slide yang disusun dengan segmen kecil DNA sebagai target. Microarray ini dibuat dengan menyimpan dan melumpuhkan sejumlah kecil DNA (probe) pada dukungan kaca padat. Ukuran probe dapat bervariasi dari oligonukleotida ke kromosom buatan bakteri.

Gambar 02: Array CGH

Terlepas dari probe, metode dasar array CGH mirip dengan CGH. Setelah probe yang mengandung microarray disiapkan, dua sampel DNA (uji dan referensi) berlabel dengan fluorofor dengan warna yang berbeda dicampur bersama dan ditambahkan ke microarray. Karena DNA dalam sampel beruntai tunggal karena denaturasi, DNA ini hibridisasi dengan probe untai tunggal yang disusun. Menggunakan sistem pencitraan digital, dimungkinkan untuk mengidentifikasi perbedaan kromosom antara kedua sumber.

Apa kesamaan antara CGH dan array CGH?

• CGH dan Array CGH adalah dua teknik untuk mendeteksi variasi nomor salinan.
• Mereka adalah metode sitogenetik molekuler.
• Kedua metode mendiagnosis kelainan kromosom yang tidak seimbang.
• Fluorofor terlibat dalam kedua metode.
• Kedua metode dapat digunakan untuk mendeteksi gangguan genetik karena variasi nomor salinan.
• Mereka banyak digunakan dalam analisis genom komparatif.

Apa perbedaan antara CGH dan array CGH?

CGH adalah metode sitogenetik molekuler tradisional untuk menganalisis variasi jumlah salinan dalam DNA sampel uji yang memiliki resolusi yang lebih rendah, sedangkan array CGH adalah metode sitogenetik molekuler yang sepenuhnya otomatis untuk menganalisis variasi jumlah salinan dalam DNA sampel uji yang memiliki resolusi yang lebih tinggi. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara CGH dan array CGH. Selanjutnya, dalam CGH, sampel DNA uji dan referensi hibridisasi dengan penyebaran metafase normal kromosom, tetapi dalam array CGH, uji dan sampel DNA referensi hibridisasi dengan probe DNA yang diimobilisasi yang mengandung microarray.

Infografis di bawah ini mencantumkan perbedaan antara CGH dan array CGH dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.

Ringkasan -CGH vs Array CGH

CGH dan array CGH adalah dua teknik sitogenetik molekuler untuk mendeteksi kelainan kromosom yang tidak seimbang. Mereka banyak digunakan dalam analisis genom komparatif. CGH adalah metode sitogenetik molekuler tradisional untuk menganalisis variasi jumlah salinan dalam DNA sampel uji yang memiliki resolusi yang lebih rendah. Sebaliknya, array CGH adalah metode sitogenetik molekuler sepenuhnya otomatis untuk menganalisis variasi jumlah salinan dalam DNA sampel uji yang memiliki resolusi yang lebih tinggi. Dengan demikian, ini merangkum perbedaan antara CGH dan array CGH.

Referensi:

1. “Hibridisasi Genomik Komparatif."Tinjauan umum | Topik ScienceDirect.
2. Heather, James M., dan Benjamin Chain. “Urutan Sequencer: Sejarah Sequencing DNA.”Genomik, Pers Akademik, 10 Nov. 2015.

Gambar milik:

1. “CGH Schema” oleh Mbaudis (Talk) (Unggah) - Pekerjaan Sendiri (CC oleh 2.5) Via Commons Wikimedia
2. “Array-CGH Protocol” oleh Philippe Hupé-Emmanuel Barillot, Laurence Calzone, Philippe Hupé, Jean-Philippe Vert, Andrei Zinovyev, Sistem Komputasi Biologi Kanker Chapman & “Hall/CRC Matematika” Biologi Komputasi, 2012 (CC S-SA 3 3.0) Via Commons Wikimedia